2012年6月14日-16日，首屆海峽兩岸衛生檢疫工作研討會在廈門舉行，來自包括國家質檢總局、臺灣“疾病管制局”、中國檢驗檢疫科學研究院及與臺灣有直航往來的11個直屬檢驗檢疫局的44位衛生檢疫專家齊聚廈門，國家質檢總局衛生司司長張際文、臺灣“疾病管制局局長”張峰義、廈門檢驗檢疫局詹思明局長等出席會議并致辭。
此次會議為期3天，會議采取包括講座和研討的形式，對輸入性傳染病的風險評估、口岸登革熱、基孔肯雅熱防控等兩岸共同關注的衛生檢疫領域的熱點問題展開了深入的探討和交流。
國家質檢總局衛生司司長張際文在會上致辭表示，大陸歷來高度重視對臺衛生檢疫工作，過去四年兩岸實現了人員、貨物的三通直航，兩岸經貿、衛生乃至教育逐步走入“雙向交流”，尤其衛生檢疫工作呈現了蓬勃發展的態勢。臺灣“疾病管制局局長”張峰義也表示，透過兩岸衛生檢疫專業交流，雙方對兩岸作業模式有了更多了解，有助于更有效、更專業地開展口岸傳染病監測等衛生檢疫工作，造福兩岸人民。
截至目前，大陸的41個空港口岸與臺灣的9個空港口岸開通了兩岸直航航線，大陸的52個海港、18個內河港共70個港口與臺灣的13個港口開通了海上客運或貨運直航航線，大陸還設立了約60個對臺小額貿易�？奎c。對臺衛生檢疫工作內容已覆蓋兩岸往來人員、直航航空器、直航船舶、對臺小額貿易船舶和兩岸往來集裝箱、貨物、尸體、棺柩等的衛生檢疫監管。
研討會期間，國家質檢總局和臺灣“疾病管制局”代表還參觀了廈門檢驗檢疫局、廈門國際郵輪中心、廈門高崎國際機場等單位，了解廈門口岸核心能力建設情況，并與廈門檢驗檢疫局就人員、交通工具的衛生檢疫，船舶衛生控制以及口岸環境衛生監督等的具體做法展開交流。
“近年來，閩臺檢驗檢疫交流合作不斷深化，取得了一系列積極成果，廈門已成為與兩岸檢驗檢疫業務交流合作最為密切的區域之一�！睆B門檢驗檢疫局局長詹思明表示，2010年，廈門檢驗檢疫作為大陸檢驗檢疫直屬機構首次參訪臺灣 “衛生署疾病管制局”，就雙方共同關注的傳染病防控個案疫情通報建立聯系渠道，從此開啟了兩岸傳染病防治合作新篇章。隨后，臺灣疾病管制分支機構參訪大陸直屬檢驗檢疫機構，也首先選擇到廈門檢驗檢疫機構�！敖陙恚p方業務交流正是從無到有、由少向多，從初期的摸索探路到現在的縱深推進，內容不斷增加，手段不斷創新，成果不斷突破；交流合作領域從口岸疫情防控，向核心能力建設等方向不斷擴大，合作成效不斷顯現。”（潘浩）
